序卷一跌打损伤小引看伤有治无治之论秘传下手口诀治周身口诀损伤秘传口诀秘传接骨口诀效方开后秘传要旨总论秘传损方药名十二咏卷二总论卷三跌打水药歌观音针（一点一针）雷火针九龙针太乙救苦针又麻药方附录经验杂方
第1部分第2部分第3部分第4部分第5部分第6部分第7部分
序序论第一果实第二（二十九条）菜蔬第三（五十八条）谷米第四（二十七条）鸟兽第五（四十条）
辩桂枝汤用芍药证（一）桂枝加附子汤证（二）桂枝加浓朴杏子汤证（三）麻黄汤证（四）大青龙汤证（五）阳明可下证（六）阳明蜜兑证（七）肾虚阳脱证（八）脐中出血证（九）阴中伏阳证（十）伤寒暴死证（十一）夜间不
卷一脉之名义气口独以为五脏主脉辨至数日夜五十营诊贵平旦寸关尺之义三焦分发三部重轻审察阴阳辨别内经分发脏腑定位六气分合六部时日诊候之图政运有不应之脉人迎气口脉分四时六气脉分四方脉分五脏五脏平脉五脏病脉五
序一序二自叙卷首 十二经络图象手太阴肺经图手阳明大肠经图足阳明胃经图足太阴脾经图手少阴心经图手太阳小肠经图足太阳膀胱经图足少阴肾经图心包络经图三焦经图足少阳胆经图足厥阴肝经图卷上肺经第一大肠经第二胃经
序卷之上淫热反克之病风热不制之病七情五贼劳役饥饱之病血为邪胜凝而不行之病气为怒伤散而不聚之病血气不分混而遂结之病热积必溃之病阳衰不能抗阴之病阴弱不能配阳之病心火乘金水衰反制之病内急外弛之病奇经客邪之病
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
简介序卷一卷二卷三卷四附
原序本草从新凡例药性总义卷一草部山草类人参珠儿参党参土人参西洋人参北沙参空沙参甘草黄精萎蕤黄野白术种白术苍术桔梗天麻秦艽柴胡前胡独活羌活防风升麻细辛远志金毛狗脊淫羊藿巴戟天琐阳肉苁蓉白芨三七地榆丹参元