序各论人参防党参西洋参北沙参甘草黄精葳蕤黄芪白术苍术桔梗天麻秦艽柴胡前胡独活羌活防风升麻细辛远志金毛狗脊淫羊藿锁阳肉苁蓉白芨三七地榆丹参元参苦参龙胆草黄连胡黄连黄芩紫草知母贝母白头翁白前白薇白鲜皮白茅
绪言卷一摄生第一阴阳第二脏象上第三脏象下第三卷二脉色上第四脉色下第四经络上第五卷三经络下第五标本第六气味第七论治第八卷四疾病第九病机邪气阴阳卷四疾病第十经脏虚实时令卷五疾病第十一五气情志风厥伤寒卷五疾
难经正义
辨症玉函
自序卷一·温病方论春温集补证治并方附：风温附：冬温附：温疟附：温毒发斑附：医案三则春温病论温热病脉论温病方五道附：集方二十九道卷二·热病方论夏热集补证治并方总论温热死脉死证附：湿温附：阳毒发斑附：阴毒
周选堂（着）序一：李序序二：章序序三：徐序编者的话卷一 冬伤于寒春必病温大意一、概述二、分述（一）春温（二）风温（三）温病（四）温毒（五）晚发选按三、拟用诸法（一）辛温解表法（二）凉解里热法（三）清热
序卷一治喉秘法治喉要诀临症二十法焦氏喉症图形针药秘传单方治喉痹单方卷二应用良方焦氏喉科煎药方诸穴灸刺各法附方
太医局诸科程文格
序一序二卷一运气（上）太极图论阴阳体象五行生成数解五行统论每日气数百刻六千分解四季日躔宿度昼夜长短刻数二十四气七十二候斗纲解十二辰次六合解二十八宿过宫歌二十八宿说中星岁差考奎壁角轸天地之门户说气数统论
咽喉总论条目辨喉证附方咽喉七十二证考