正文以上发明病根，是本段之前半截。下乃备引经义，以证其实而足其理。以上论理升降出入，是病机也。推病根，为第二段。以上推论化气，发明标本，是补足前半篇义理，为第三段。以下论五味补泻治法，退出通篇，为第四
神农尝百草论亢则害承乃制论四气所伤论张仲景伤寒立法考伤寒温病热病说伤寒三阴病或寒或热辨阳虚阴盛阳盛阴虚论伤寒三百九十七法辨伤寒四逆厥辨呕吐干呕哕咳逆辨中风辨中暑中热辨积热沉寒论泻南方补北方论五郁论二阳
自序一自序二卷上外症用刀针法火针不可轻用治筋缩法治足筋缩法浮皮兜脓须剪开升药所忌背部湿痰块痔漏疮鸡胸症龟背症虚人有病易昏愦病挟气郁宜审治少壮妇女病要法治孕妇病法时疫捷法（先看两肩有红点）产后治法大略温
医学发明
药性赋第一章 寒性药第二章 热性药第三章 温性药第四章 平性药
重刊宋本洪氏集验方序重刊宋本洪氏集验方后叙卷第一治痢肉豆蔻散祛疟散大交泰丹混元胎丹还少丹琼玉膏一粒金丹神妙六逸丸铁瓮申先生交感丹降气汤牙药卷第二（痈疽）化毒排脓内补散神授痈疽灵方治乳痈发背，诸般疮毒灵
易牙遗意
一百二十穴玉龙歌中风口眼斜头风偏正头风头风痰饮头项强痛牙疼乳蛾鼻渊不闻香臭眉目间痛心痛三焦上焦热痴呆赤目目病隐涩目热目烂目昏耳聋聋疠喑痰嗽喘急咳嗽腰痛伤风咳嗽鼻流清涕喘气喘哮喘痰嗽口气气满气肩肿痛肘挛
自序卷一证治总论气血精神论升降出入论承制生化论虚实补泻论卷二上形气类三阴三阳名义一三阴三阳名义二三阴三阳名义三高骨大骨非一骨也三焦水道膀胱津液论饮入于胃游溢精气上输于脾脾气散精上归于肺通调水道下输膀胱
脉法行经三忌恶阻论胞漏并小产论诸痛论胎逆上逼胀满子悬论诸血症论子肿子气子满论子烦并五心烦热及烦躁口干论子淋论转胞淋闭论子嗽论喘急论泄泻论霍乱论中恶中暑中湿中风论子痫论（一名子冒）痢论疟论伤寒温热时疫论