简介序卷之一卷之二卷之三卷之四卷之五卷之六卷之七卷之八卷之九卷之十卷之十一卷之十二卷之十三卷之十四卷之十五卷之十六卷之十七卷之十八卷之十九卷之二十丹波元胤跋
首序自序性命篇上性命篇下补遗篇一补遗篇二辟邪篇太极图说注解序周子太极图（缺）无极而太极后跋
广温疫论
总论幼科论治初生保胎外热内热辨非惊论痰火闭症木侮土症指纹晰义指纹切要小儿脉法初诞救护调燮须注意脐风症论初生后小儿之杂症治法婴儿护持得法可以避病说药饵不可轻服论不经医对病服药之误论观形象以辨寿夭论望形色
《难经》简介《难经》论脉一难二难三难四难五难六难七难八难九难十难十一难十二难十三难十四难十五难十六难十七难十八难十九难二十难二十一难二十二难论经络二十三难二十四难二十五难二十六难二十七难二十八难二十九
通俗序壶天性果女丹十则（一卷）第一则·养真化气第二则·九转炼形第三则·运用火符第四则·默运胎息第五则·广立功行第六则·志坚行持第七则·调养元神第八则·移神出壳第九则·待度飞升第十则·了道成真女金丹序上
石药尔雅
第1部分第2部分第3部分第4部分第5部分第6部分第7部分
小引卷一水部诸水火部诸火土部诸土金部金赤铜铜青自然铜古文钱铅铅粉铅丹密陀僧锡铁落针砂铁精铁锈石部玉云母白石英紫石英丹砂银朱水银轻粉灵砂雄黄雌黄石膏滑石赤石脂炉甘石无名异石钟乳锻石浮石阳起石磁石代赭石禹
序（一）自记序（二）重刻外科证治弁言凡例卷一痈疽证治统论痈疽部位名记胃气论论肿论溃论敛论痛论痒五善歌七恶歌饮食宜忌论阳痈证治则例阴疽证治则例烂溃不敛治法翻花起肛治法患孔毒根治法漏管治法多骨治法毒瓦斯攻