卷第一叙论太阳证阳明证少阳证太阴证少阴证厥阴证两感证三阴三阳传病证卷第二可发汗证不可发汗证四逆证和表证可下证（血证附）不可下证可水不可水证可吐不可吐证可灸不可灸证可火不可火证可温证火邪证卷第三结胸证心
《续编》序卷上赤石脂栝楼根蜀漆生姜卷下桃仁巴豆蜜虫虻虫阿胶粳米小麦大麦粉赤小豆胶饴酒醇酒清酒法醋苦酒美酒酰白酒浆水清浆水白饮饮暖水沸汤麻沸汤鸡子白鸡子黄鸡屎白马通汁猪膏猪脂猪肤猪胆獭肝羊胆羊肉蜘蛛蛴螬
十剂表
佛点头脉诀
凡例卷一九恨十三不可学十传摹看手指筋纹乃医家异教说治病不可关门杀贼说治病不可开门揖盗说汤方内更换药味说看病秘诀死症辨卓溪家传口诀推拿代药赋卷二阐明五脏生克以知补母泻子辨脐风辨胎寒辨胎热辨胎毒发丹辨胎惊
卷第一（求端探本）凡一门求子方论卷第二（方书叙例）凡十三门叙初有小儿方第一叙小儿有病与大人不殊第二叙小儿方可酌量药品分两第三叙小儿有病宜早治第四叙调理小儿第五叙修合药第六叙用药第七叙小儿气弱不可容易吐
验方徐果亭先生试验神方送蛋药酒方（男人服）种子红药连城丸老奴丸（一名苍龙丸）又种子奇方种子金丸种子金丸如意线方长龟方（一）秘传壮阳固精酒奇妙方涤痿兴阳汤安息香闻香起马方治腰痛神方补腰益肾壮元阳补血气圣
简介序凡例卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八卷九卷十卷十一卷十二卷十三卷十四卷十五卷十六卷十七卷十八卷十九卷二十卷二十一卷二十二卷二十三附录
脏腑虚实标本用药式
自叙绪说卷一石膏赤石脂硝石、芒硝甘草黄人参沙参桔梗知母白术黄连黄芩柴胡白藓皮龙胆芍药牡丹卷二木香补骨脂姜黄、郁金荆芥薄荷青蒿夏枯草漏芦麻黄麦门冬瞿麦葶苈车前子蓄大黄附子、天雄、乌头半夏荛花菟丝子五味子