卷第一叙论太阳证阳明证少阳证太阴证少阴证厥阴证两感证三阴三阳传病证卷第二可发汗证不可发汗证四逆证和表证可下证（血证附）不可下证可水不可水证可吐不可吐证可灸不可灸证可火不可火证可温证火邪证卷第三结胸证心
第1部分第2部分第3部分
简介细目序凡例卷一卷二卷三卷四跋
简介本草纲目拾遗小序卷一 水部卷二 火部·土部·金部·石部卷三 草部上卷四 草部中卷五 草部下卷六 木部卷七 藤部·花部·果部上卷八 果部下·诸谷部·诸蔬部卷九 器用部·禽部·兽部卷十 鳞部·介部·虫
例言卷一中风（附：类中）附类中风风痫诸症感冒伤风伤寒暑症（附：痧症）霍乱吐泻（附：转筋）泄泻咳嗽（附：哮喘痰症）疟疾心腹痛（附：胁痛闪痛）脾胃（附：呃逆 翻胃噎膈）腰痛诸药食毒卷二血症劳损诸症（附：怔
自序卷一祷告药皇誓疏温证论治人身一小天地论书方宜人共识说卷二日讲杂记《金匮》上工治未病一节辩辨《金匮》之二阳之病发心脾解维脉为病论治张、刘、李、朱后，当以薛、张、吴、喻配为八大家论医宜博览论读《伤寒补
武当淮河派丹丸膏散秘方
易牙遗意
序一序二序三卷一卷二卷三疹痧疹附录吴山散记小引吴山散记
潘序黄序王序马评汤序马评吴序自序凡例重订凡例卷一痈疽总论部位论名烂溃不敛患孔毒根翻花起肛毒瓦斯攻心阴症门阴疽论阴疽治法流注甲疽井泉疽瘰小肠疽鹤膝风横乳岩贴骨疽骨槽风恶核痰核石疽善头鹅掌风鹅爪风冻疮阴疽