《仁斋直指》序卷之一总论五脏所主论五脏病证虚实论诸阴诸阳论血营气卫论脉病逆顺论男女气血则一论问病论论《易简方论》附∶原脉论（出《保命集》）附论五篇（出《丹溪心法》）附∶十二经脉歌火湿分治论虚实分治论附
序序凡例卷一述原引种预防禁忌辨证卷二论治（上）卷三论治（下）卷四运气选案
中风虚劳咳嗽失音肺痿呃逆吐血衄血便血哮喘痰饮痞疝积聚痹痿痉厥癫痫三消郁肿胀遗精淋浊呕吐噎膈吐蛔痛头风温热疫毒疹暑湿黄胆疟疾痢泄泻便闭五窍
自叙卷一草部苍术黄精益智仁草豆蔻缩砂仁补骨脂肉豆蔻胡芦巴白豆蔻红豆蔻大茴香香附荜拨藿香香薷荜澄茄使君子威灵仙白附子慈菰牵牛子何首乌肉苁蓉锁阳丹参泽兰益母草刘寄奴延胡索胭脂（艹/閶）茹姜黄地榆三七蒲黄续
简介凡例卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八卷九卷十卷十一卷十二卷十三卷十四卷十五卷十六卷十七
卷一妇女逐年经症室女十三四岁行经室女十五六岁妇女十七八岁妇人十九二十嫁出时妇人二十一二妇人二十三四妇人二十五六妇人二十七八妇人二十九三十妇人三十四五妇人三十六七妇人三十八九妇人五十一二卷二诊妇人有孕论
刘序凡例正面图（图缺）背面图（图缺）指节图灸盏图灸药神方人神在曰不宜灸单十二时人神所在不宜针灸歌十二支曰人神所在不宜针灸歌十干曰人神所在不宜针灸歌尻神图九宫尻神歌应灸七十症中风尸厥偏风眩晕痿症痹症劳伤
第1部分第2部分第3部分第4部分第5部分第6部分
吴序张序自序张声驰序卷上人身一小天地论阴阳互根论五行生克论阴阳治法大要论枢机论卫气行度一经星经天论营气行度一经水行地论百病提纲论望病须察神气论卷中闻声须察阴阳论问证求病论切脉源流论内伤大要论湿气论卷下
自叙凡例白喉证论辩证法辨脉法用药法白喉热证尚轻治法白喉热证渐重治法白喉寒证尚轻治法白喉寒证渐重治法白喉虚热证治法白喉虚寒证治法白喉寒热错杂证治法续方白喉误治坏证治法白喉愈后补虚治法妇人白喉证小儿白喉证