《仁斋直指》序卷之一总论五脏所主论五脏病证虚实论诸阴诸阳论血营气卫论脉病逆顺论男女气血则一论问病论论《易简方论》附∶原脉论（出《保命集》）附论五篇（出《丹溪心法》）附∶十二经脉歌火湿分治论虚实分治论附
序序凡例卷一述原引种预防禁忌辨证卷二论治（上）卷三论治（下）卷四运气选案
中风虚劳咳嗽失音肺痿呃逆吐血衄血便血哮喘痰饮痞疝积聚痹痿痉厥癫痫三消郁肿胀遗精淋浊呕吐噎膈吐蛔痛头风温热疫毒疹暑湿黄胆疟疾痢泄泻便闭五窍
曹序自序序例卷之一·阴阳脏腑部阴阳五脏卷之二·阴阳脏腑部诊法通论诊虚实法、诊寒热法（俱入治法）诊病传变（诊病将死期入诊生死条）诊病愈剧诊生死诸脉诊病杂法诊一岁病证相同卷之三·阴阳脏腑部治法通论倒仓法药
序凡例原叙卷首诊法五脏六腑经气望色闻声问证切脉卷一证治背上头骨两耳眼目唇口鼻孔齿牙舌本咽喉胸前大腹小腹胁肋腰中手臂脚腿前阴后阴大便小便卷二证治寒热呕吐咳嗽喘失血遗精言语心神斑黄出汗肿胀饮食起居倒仆掣动
凡例记录十四科初生护养入门审候歌观面部五色三关脉纹主病歌上卷急慢惊风（附∶慢脾）疳积诸吐诸泻吐泻霍乱吐泻疟疾痢疾脱肛咳嗽龟胸龟背伤积伤食伤寒热症痧症喘症??症痫症积聚黄胆诸血头痛颈项强痛腹痛胃脘痛（附
卷之一周身经穴赋十二经脉歌十二经本一脉歌经穴起止歌十五脉络歌经脉气血多少歌禁针穴歌禁灸穴歌血忌歌逐日人神歌九宫尻神歌太乙人神歌孙思邈先生针十三鬼穴歌长桑君天星秘诀歌马丹阳天星十二穴并治杂病歌四总穴歌千
宣明方论
许氏医案
序一序二序三序四序五述古八则麻疯二十一论麻疯三十六种辨症图说五不治（轻亦可治）五主治内治九法外治六法疯门总论疯门总药正治诸方变治诸方攻下诸方外治诸方点痣法瘰烂法雷火针法千金方