自序卷上石膏滑石芒硝甘草黄人参桔梗术白头翁卷中黄连黄芩柴胡贝母细辛当归芎芍药牡丹皮茵陈蒿艾麻黄地黄葶苈大黄大戟甘遂附子半夏芫花五味子栝蒌实葛根防己卷下香豉泽泻薏苡仁薤白干姜杏仁大枣橘皮吴茱萸瓜蒂桂枝浓
伤寒心境别集
医案精华
醉花窗医案
首序自序性命篇上性命篇下补遗篇一补遗篇二辟邪篇太极图说注解序周子太极图（缺）无极而太极后跋
自序卷一祷告药皇誓疏温证论治人身一小天地论书方宜人共识说卷二日讲杂记《金匮》上工治未病一节辩辨《金匮》之二阳之病发心脾解维脉为病论治张、刘、李、朱后，当以薛、张、吴、喻配为八大家论医宜博览论读《伤寒补
《难经》简介《难经》论脉一难二难三难四难五难六难七难八难九难十难十一难十二难十三难十四难十五难十六难十七难十八难十九难二十难二十一难二十二难论经络二十三难二十四难二十五难二十六难二十七难二十八难二十九
广嗣五种备要
序产后总论胞衣不下块痛血崩血晕手足厥冷类伤寒类中风类疟妄言妄见气短发喘咳嗽自汗盗汗大便不通小便不通呕吐不纳谷伤食膨胀泄泻痢疾烦闷产后调护法
《滇南本草》序一《滇南本草》抄本跋《滇南本草》抄本后序重刊《滇南本草》序《滇南本草》序二第一卷石莲花木贼贯众七星草石苇白果松节、松笔头、松香、地盘松球侧柏叶玉兰花野棉花云连白芍、赤芍牡丹皮鸡头实荷叶藕